Drugi del Skrivnostna celina kaže tudi zgodbo slovenske prisotnosti na otoku, od usmiljenih sester in redovnic do misijonarja Pedra Opeke.
Začne se v Matangi s prastarim ptičjim plesom, ki so ga malgaški predniki prinesli iz Afrike. A prvi prebivalci otoka so bili indonezijskega izvora. Ob reki Mašijanka se že 40 let odvija tudi zgodba slovenske prisotnosti. Spoznamo Izidorja, ki nam predstavi misijon ter veliko šolo z navdušenimi učenci, ki so jo postavili z darovi iz Slovenije. Ekipa obišče velikega kralja Antešakov in nadaljuje pot proti mestu Farafangana ob Indijskem oceanu. S Tonetom potujejo v malgaške samote v osrednjem delu otoka, z nočno vožnjo po pragozdu in zanimivim razkritjem ob krokodilji reki v Befotaki. Gledalca fascinira obisk pri enem najmogočnejših malgaških vračev Damasua, ki je mojster urokov, zdravilstva in prerokovanja. Najzanimivejši slovenski del malgaške zgodbe sta pogumni usmiljenki Terezija in Marija, ki s skoraj osmimi križi, vodita bolnice na otoku, pa neutrudna Jože in Janez, ter Ana, ki je kot prostovoljka postala babica v enem od dispanzerjev. Edini potniški vlak Manakara Fiaranatsoa – nas popelje na visoko planoto, kjer srečamo azijski svet s čudovitimi riževimi polji plemen Betsileo in Merna. V prestolnici Antananarivo, se dopolni politična podoba Madagaskarja z obiskom predsednika Rayoline in misijonarja Pedra Opeke. Pot po skrivnostni celini pa zaključujmo s pragozdom in edinstvenimi lemurji Indriji ter skokom na skrajni sever, kjer se v smaragdnem morju zrcali spomin na piratsko državo Libertanijo.