Tožilstvo Železniku očita, da 25 zadev ni razporedil in izročil kazenski pisarni za vpis v ustrezne vpisnike, zaradi česar so najmanj štiri zastarale. Kot je dejal Železnik v pisnem odgovoru na vprašanja sodišča, kot tožilec ni mogel storiti kaznivega dejanja, ampak kvečjemu disciplinski prekršek, saj sam ni ničesar vpisoval. Tožilci so obtožni predlog zaradi kaznivega dejanja ponareditve uradne listine, za katerega je predvidena kazen tri leta zapora, vložili že pred enim letom.

Ob začetku kazenske obravnave na ljubljanskem okrajnem sodišču je Železnik podal samo pisni odgovor na vprašanja sodišča, na vprašanja tožilstva pa ni odgovarjal. Tudi novinarjem ni dajal izjav.

Spomladi leta 2004 so o Železniku začele krožiti govorice, da svojega dela ne opravlja dobro. Izkazalo se je, da je zapustil kar 377 nerešenih zadev, med njimi jih je 38 zastaralo.

Sodišče bo proces proti Železniku nadaljevalo 9. novembra. Tedaj naj bi zaslišalo nekdanjega namestnika vodje ljubljanskega okrožnega tožilstva Matijo Benuliča, ki je zaradi afere Železnik odstopil.