Razstava Boj proti veri in Cerkvi je nastala po predlogi knjige Cerkev na zatožni klopi (2005) Tamare Griesser Pečar, ki je tudi avtorica pričujoče postavitve. "Razstava bo prikazala nasilje nad Cerkvijo na vseh področjih," je med pripravami na razstavo dejala zgodovinarka in dodala, da bo na razstavi tudi seznam z imeni vseh duhovnikov, redovnikov in bogoslovcev, ki so jih v omenjenem obdobju zaprli, kaznovali ali ubili predstavniki tedanje komunistične oblasti. Seznam naj bi obsegal 630 imen. "Glede na to, da je bilo v Sloveniji takrat povprečno približno 1000 duhovnikov, je to ogromna številka," opozarja Griesser Pečarjeva.

V avli muzeja je postavljen šestmetrski križ, ki so ga leta 1953 predstavniki komunistične oblasti odstranili z vrha Škrlatice in vrgli v severozahodno steno gore. Ostanke križa so doslej hranili v župnišču Dovje.