Kvalifikacijski trening v Sepangu je bil razburljiv, saj so se dirkači na prvem mestu izmenjevali kot za stavo. Na koncu se je veselil 22-letni Španec, ki je novega svetovnega prvaka Caseyja Stonerja prehitel za 41 tisočink. Iz prve vrste bo štartal še Marco Melandri, ki je zaostal za 67 tisočink. Valentino Rossi je bil šele 9. Čeprav je bil Pedrosa najhitrejši že v kvalifikacijah v Avstraliji in na Japonskem, mu na dirki ni uspelo zmagati.

V razredu do 250 ccm je bil najhitrejši Japonec Hiroši Aojama, v razredu do 125 ccm pa Španec Hector Faubel pred edinim tekmecem za naslov prvaka, Madžarom Gaborjem Talmacsijem. Do konca sezone sta še dirki v Maleziji in Španiji.

MotoGP, kvalifikacije:                 
 1. D. PEDROSA    ŠPA/honda    2:01,877
 2. C. STONER     AVS/ducati     +0,041
 3. M. MELANDRI   ITA/honda       0,067
 4. R. DE PUNIET  FRA/kawasaki    0,230
 5. A. WEST       AVS/kawasaki    0,325
 6. N. HAYDEN     ZDA/honda       0,348
 7. C. VERMEULEN  AVS/suzuki      0,424
 8. T. ELIAS      ŠPA/honda       0,555
 9. V. ROSSI      ITA/yamaha      0,589
10. J. HOPKINS    ZDA/suzuki      0,820

250 ccm, kvalifikacije:                
 1. H. AOJAMA     JAP/KTM      2:07,420
 2. M. KALLIO     FIN/KTM        +0,032
 3. J. LORENZO    ŠPA/aprilia     0,192
 4. A. DOVIZIOSO  ITA/honda       0,246
 5. A. BAUTISTA   ŠPA/aprilia     0,356
 6. T. LUTHI      ŠVI/aprilia     0,510
 7. H. BARBERA    ŠPA/aprilia     0,719
 8. J. SIMON      ŠPA/honda       1,067
 9. A. DE ANGELIS SMR/aprilia     1,316
10. R. LOCATELLI  ITA/gilera      1,524

125 ccm, kvalifikacije:                
 1. H. FAUBEL     ŠPA/aprilia  2:13,327
 2. G. TALMACSI   MAD/aprilia    +0,116
 3. S. CORTESE    NEM/aprilia     0,814
 4. P. ESPARGARO  ŠPA/aprilia     0,839
 5. S. CORSI      ITA/aprilia     1,020
 6. T. KOJAMA     JAP/KTM         1,113
 7. L. PEŠEK      ČEŠ/derbi       1,303
 8. J. OLIVE      ŠPA/aprilia     1,396
 9. P. NIETO      ŠPA/aprilia     1,411
10. M. PASINI     ITA/aprilia     1,471

SKUPNI VRSTNI RED                      
MotoGP (16/18):                        
 1. C. STONER     AVS/ducati   322 točk
 2. V. ROSSI      ITA/yamaha   230     
 3. D. PEDROSA    ŠPA/honda    201     
 4. J. HOPKINS    ZDA/suzuki   165     
 5. C. VERMEULEN  AVS/suzuki   160     
250 ccm (15/17):                       
 1. J. LORENZO    ŠPA/aprilia  287     
 2. A. DOVIZIOSO  ITA/honda    242     
 3. A. DE ANGELIS SMR/aprilla  215     
 4. A. BAUTISTA   ŠPA/aprilia  181     
 5. H. BARBERA    ŠPA/aprilla  146     
125 ccm (15/17):                       
 1. G. TALMACSI   MAD/aprilia  237     
 2. H. FAUBEL     ŠPA/aprilia  236     
 3. T. KOJAMA     JAP/KTM      166     
 4. L. PEŠEK      ČEŠ/derbi    161     
 5. S. CORSI      ITA/aprilia  155     

R. K.