Zanj je značilno gibanje ogromnega vala tople vode z zahoda proti vzhodu, in sicer na obeh straneh Tihega oceana. Po poročanju ameriških oblasti je El Ninjo omilil delovanje orkanov, ker preprečuje njihovo oblikovanje na Atlantiku, pozimi pa naj bi pripomogel k višjim temperaturam ponekod v Kanadi in ZDA.

El Ninjo je skupek oceanskih in podnebnih pojavov, ki se pojavijo približno vsakih nekaj let in povzročijo ogromno škode. Zadnja pojava El Ninja sta bila v letih 1982/1983 in 1996/1997.