Klubi bodo v Top16 razdeljeni v štiri skupine s po štirimi moštvi. Pred žrebom so ekipe v štirih bobnih glede na uvrstitev v prvem delu.
1. boben: Maccabi, Olympiacos, Siena, Panathinaikos
2. boben: Caja Laboral, Real Madrid, Fenerbahče, Union Olimpija
3. boben: Žalgiris, Unicaja, Barcelona, Efes Pilsen
4. boben: Partizan, Lottomatica Roma, Lietuvos Rytas, Valencia

Prvi kriterij - ni združevanja ekip iz 1. dela
Kriterja pred žrebom sta dva. Prvi je, da se ekipe, ki so igrale v isti skupini v prvem delu, v Top16 ne morejo pomeriti med seboj. Drugi je, da so lahko iz iste države, v skupini največ po dva kluba. Iz zornega kota Ljubljančanov je torej možnih 6 kombinacij.

1. kombinacija: Maccabi, Unicaja, Lietuvos Rytas
2. kombinacija: Maccabi, Barcelona, Lottomatica Roma
3. kombinacija: Olympiacos, Žalgiris, Lietuvos Rytas
4. kombinacija: Olympiacos, Barcelona, Partizan
5. kombinacija: Siena, Žalgiris, Lottomatica Roma
6. kombinacija: Siena, Unicaja, Partizan

Drugi kriterij - poskus razdruževanja ekip iz iste države (tudi iz Lige NLB)
Vendar ... Vodstvo Evrolige bo skušalo, če bo to le mogoče, "razdružiti" tudi klube iz iste države in Jadranske lige (Olimpija, Partizan). Izjema je seveda Španija, ki ima v Top16 pet predstavnikov. Če bi upoštevali še to predpostavko, bi v "igri" ostala le še druga kombinacija, kar bi pomenilo, da bi se Union Olimpija v drugem delu pomerila z Maccabijem, Barcelono in rimsko Lottomatico.

Najprej žrebajo iz prvega bobna
A žreb se začne "od zgoraj navzdol", kar pomeni, da bodo najprej vlekli iz prvega bobna, nato iz drugega itd. Olimpija lahko torej namesto Maccabija izvleče tudi Olympiacos in Sieno, preden pride do zgoraj omenjenega pravila.