S tem je posredno prvič priznal ugibanja, da ima Cia svoje zapore, ki so v nekaterih državah povzročili številna negodovanja. Hkrati je zagovarjal tajni program obveščevalne agencije Cia, ki naj bi bil glavni vir informacij za boj proti terorizmu. Govoril je pred družinskimi člani žrtev napada v New Yorku leta 2001.

Bush je tudi napovedal, da bodo 14 domnevnih teroristov, med katerimi naj bi bil glavni organizator napadov 11. septembra 2001, Kalid Šejk Mohamed, iz zaporov Cie predali obrambnemu ministrstvu, ki naj bi jim v ameriškem oporišču Guantanamo na Kubi tudi sodilo.

Med omenjenimi naj bi bili sicer tudi odgovorni za bombardiranje ameriške vojaške ladje USS Cole leta 2000 v Jemnu in za napade na ameriški veleposlaništvi v Keniji in Tanzaniji leta 1998.

Parlamentarna skupščina Sveta Evrope je junija ZDA pozvala, naj odpravijo sistem tajnih priporov in nezakonitih prevozov domnevnih teroristov med državami. Zahtevali so tudi revizijo že sprejetih dvostranskih sporazumov med državami članicami SE-ja in ZDA, posebej tistih, ki zadevajo status ameriških sil v Evropi.