Skupaj z oskarjevima nagrajencema Milošem Formanom in Jiržijem Menzlom je bila del novega vala češkoslovaškega filma, ki se je oddaljil od tedanjega komunističnega režima.

Chytilova je pozornost filmske srenje vzbudila s svojimi kratkimi filmi v zgodnjih 60. letih prejšnjega stoletja. Leta 1966 je doživela hvalo s celovečernim filmom Marjetice (Sedmikrasky) o dveh igrivih mladih ženskah. Komunisti so ga nemudoma prepovedali, toda leto pozneje je osvojil grand prix na filmskem festivalu v italijanskem Bergamu.

Ker je v svoji satiri opozarjala na nesmisle življenja pod komunizmom, ji je češkoslovaška vlada za več let prepovedala filmsko ustvarjanje. Vrnila se je leta 1976 s filmom The Apple Game o odnosu med zdravnikom in medicinsko sestro. Film je dobil nagrado na mednarodnem filmskem festivalu v Chicagu.