Za mesto generalnega direktorja se lahko potegujejo posamezniki z univerzitetno izobrazbo in dodatno izobrazbo na področju upravljanja ter z najmanj petimi leti delovnih izkušenj na področju organizacije, vodenja in upravljanja. Kandidat mora ob prijavi predložiti tudi program dela in razvoja Kliničnega centra.

Kot je znano, je generalni direktor zavoda Franc Hočevar 22. aprila odstopil iz osebnih razlogov, do konca maja pa bo opravljal funkcijo vršilca dolžnosti.