Milošević je bil v Haagu v 66 točkah obtožnice osumljen genocida, zločinov proti človečnosti, kršitev ženevske konvencije ter kršenja zakonov in običajev vojne zaradi vojn na Hrvaškem, v Bosni in Hercegovini in na Kosovu. Konca sojenja ni dočakal. Zaradi srčnega napada je umrl v svoji celici v Scheveningenu. Z amsterdamskega letališča so Miloševićeve posmrtne ostanke z redno linijo JAT-a prepeljali v Beograd. Njegovi privrženci so se lahko od nekdanjega predsednika poslovili v Muzeju revolucije, nato je bila krsta prepeljana pred poslopje zveznega parlamenta.