Stakić je bil obtožen tudi genocida, vendar ga je sodišče te tožbe oprostilo. Muslimani in Hrvati na območju Prijedora so bili najprej žrtve nasilja vojske bosanskih Srbov, preživele pa so nato odpeljali v taborišča, kjer so bili številni izstradani, mučeni in ubiti.

Od ustanovitve sodišča je bil en obtoženec spoznan za krivega genocida, in sicer general Radislav Krstić. To je najvišja kazen, ki jo je sodišče do zdaj izreklo.