Muzej so uredili v objektu t. i. stare depandanse znotraj zgodovinskega stavbnega jedra kobilarne. Na več kot 300 m2 predstavlja vse najpomembnejše informacije o Lipici in lipicancih, predstavljene v treh glavnih tematskih sklopih in treh prostorih, ki tudi po barvah naznačujejo življenjski krog lipicanca od temne, skoraj črne, preko rjave do povsem bele barve. Prvi prostor ponuja zgodbo o nastanku in lastnostih lipicanca, povezanost konja s človekom in njegove upodobitve v mitologiji in umetnosti. Osrednji del predstavlja zgodovino lipiške kobilarne vključno z vsakdanjim življenjem konj v Lipici, v zadnjem prostoru je posebna pozornost namenjena predstavitvi življenjskega okolja lipicanca ter razumevanju Kobilarne kot kulturnega spomenika. Muzej obiskovalcem omogoča samostojen ogled, v prihodnje pa bo tudi izhodiščna točka vodenih ogledov po kobilarni.

Interaktivna in doživljajska predstavitev
Postavitev, ki temelji na sodobnih principih muzejske interpretacije, z doživljajskimi, interaktivnimi in multimedijskimi predstavitvami, z glasbo, igro in raznovrstnimi izzivi, obiskovalce nagovarja preko vseh čutil ter omogoča raznolike možnosti za spoznavanje predstavljene vsebine. Takšna muzejska predstavitev tako kljub omejenosti muzejskih predmetov zgodbo o lipiških konjih pripoveduje zanimivo in komunikativno pristopa do obiskovalcev, saj bo obiskovalcem omogočal, da sami pridejo do želenih informacij. Posebna pozornost bo namenjena tudi najmlajšim.

Muzej del prenovljene podobe Kobilarne
Projekt muzeja, ki so ga začeli 2005, so odprli na Svetovni dan muzejev in predvečer rojstnega dneva Kobilarne Lipica. S finančno podporo sta projekt omogočila Norveški finančni mehanizem in Finančni mehanizem EGP ter Ministrstvo za kulturo. Z njim nadaljujejo prenovljeno podobo Kobilarne in razširjajo kulturno ter turistično ponudbo Kobilarne; ob tem bodo oblikovali tudi nove tiskovine kobilarne, prenovili vodene oglede po posestvu in pripravili označevalne table za lažji samostojni ogled in spoznavanje širšega lipiškega posestva.

Odprtje so zaznamovali direktor Kobilarne Tomi Rumpf, ministrica za kulturo Majda Širca in veleposlanica Kraljevine Norveške v Sloveniji Guro Katharina Helwig Vikør, popestrili pa ga bodo glasbenim in baletnim nastopom Srednje glasbene šole iz Sežane in Baletne plesne skupine Sežana.