Mesić se je med obiskom v Vatikanu prvič srečal s papežem Benediktom XVI. in največ časa sta namenila pogovorom o približevanju Hrvaške Evropski uniji, odnosih v regiji ter o odnosih Cerkve in politike.

V pogovoru o slovensko-hrvaških odnosih je po Mesićevih besedah papež pozval, naj se "v miru najde najboljša rešitev".

"Dejal sem, da se politični eliti pogajata, ne bi pa bilo dobro, da se to prenaša globlje med ljudi, v družbo. Gre za sosednji in prijateljski državi in ne bi bilo dobro, da se ta spor poglablja, posebno zdaj, ko je podpisan sporazum, ki bo privedel do rešitve, ki bo zadovoljila tako eno kot drugo stran," je povedal Mesić.

"Svetega očeta je zanimalo ravno to, kako mi gledamo na to. O tem se ni posebej izrekal, želi si samo, da se v miru najde najboljša rešitev," je povedal Mesić o nedavnem sporu hrvaških in slovenskih škofov, ko gre za vprašanje arbitražnega sporazuma za rešitev vprašanja meje med Slovenijo in Hrvaško.

Mesić: Dolžan sem ščititi ustavo
Zaradi trenj v odnosih Mesića in hrvaške Cerkve se je v medijih ugibalo, ali bo hrvaški predsednik načel tudi vprašanje izobešanja verskih simbolov na javnih krajih. "Omenil sem mu, da sem bil izvoljen za predsednika republike in da sem dolžan ščititi ustavo," je dejal Mesić in dodal, da se s Cerkvijo na Hrvaškem ni vedno razumel, vendar pa "v Vatikanu ni težav".

Med obiskom je Mesić, ki je pred koncem svojega drugega predsedniškega mandata, ponovil povabilo papežu, naj obišče Hrvaško. Papež mu je dejal, da bo, takoj ko bodo možnosti za to, ta obisk uresničil. V petek se bo hrvaški predsednik sešel še z italijanskim kolegom Giorgiom Napolitanom, s katerim bosta po napovedih spregovorila o temah, kot sta širitev EU-ja in hitrost hrvaškega vključevanja v povezavo.