Temperature na južnem polu so za okoli 10 stopinj Celzija višje kot drugod na planetu, kjer je povprečna temperatura nižja od 200 stopinj Celzija pod ničlo. Najverjetnejši razlog za višje temperature je to, da na Neptunu arktično poletje traja 40 let. V tem času lahko svetloba in toplota ustvarita velike razlike med posameznimi območji.

Neptun je od Sonca oddaljen 4,5 milijarde kilometrov, leto na Neptunu pa traja okoli 165 Zemljinih let. Ker je Neptun tako oddaljen od Sonca, dobi le eno devetstotino količine svetlobe, ki jo dobi Zemlja.

Toplota je tako odtalila metan v planetovi atmosferi, ki je običajno ujet med led, in s tem sprostila ta plin. Tako južni pol pokriva osemkrat več kot drugod na planetu. S tem je pojasnjena tudi obilica metana v Neptunovi stratosferi, za katero znanstveniki do zdaj niso našli vzroka.