Študije naj bi pokazale, da bi ograja, opremljena z visoko občutljivimi senzorji in lučmi, negativno vplivala na živali. Bojijo se, da bo pregrada živali razdelila v manjše skupine, to pa bi lahko vplivalo na njihovo genetsko raznovrstnost. Mehiški okoljevarstveniki so prepričani, da bi negativni vpliv med drugim občutili populaciji jaguarja in mehiškega črnega medveda.

Poleg tega bi pregrada ogrozila področja, kot so Baja California, Sonora in Arizona. Predlagajo, da ZDA namesto ograje vzpostavijo zelena območja brez cest ali nasade kaktusov.