Ministrstvo je investitorju načrtovane gradnje na Muzejskem trgu v Kopru izdalo kulturno-varstveno soglasje za raziskavo in odstranitev nekdanjega vodnega zbiralnika, s tem pa se ni strinjal Zavod za varstvo kulturne dediščine Slovenije (ZVKDS), ki je želel biti stranka v postopku. Na zavodu tudi menijo, da so zastopnik javnih interesov.
Sodišče se s tem ni strinjalo, med drugim pa je tudi ugotovilo, da so navedbe zavoda o kršenju ustavnih pravic neutemeljene, so sporočili z občine.
Na območju Muzejskega trga je nameravala družba Mons zgraditi podzemno garažo, a so med arheološkimi izkopavanji, ki so jih morali opraviti pred načrtovano gradnjo podzemne garažne hiše in poslovno-stanovanjskega objekta, aprila 2009 odkrili ostanke srednjeveške bazilike ter šest podzemnih cistern za vodo, od tega so štiri ohranjene.
Družba Mons, sicer hčerinsko podjetje Kranjske investicijske družbe, je od ministrstva lani dobila dovoljenje za nadzorovano odstranitev cisterne, na kar se je pritožila piranska območna enota ZVKDS-ja. Ker je upravno sodišče zavrnilo predlog za izdajo začasne odredbe, ki bi zadržala odločbo ministrstva, so se v ZVKDS-ju odločili za tožbo ministrstva.