Ugotovili so namreč, da se pri napadu migrene aktivira regija hipotalamusa, ki je bil že dolgo osumljen kot en od možnih "krivcev" za to težavo. Vendar pa so glavni vzrok pripisovali spremembam v možganskem deblu ali skorji.

Novost pri tokratnem opazovanju, pri katerem so uporabili postopek tomografije, ki primerja različne aktivnosti v možganih, je bila, da so pacienti morali prihiteti takoj, ko se jih je migrena lotila, poleg tega pa njihovi glavoboli tokrat niso bili sproženi umetno.

Znano pa je že, da je hipotalamus odgovoren za ciklične glavobole, ki se pojavljajo v določenem časovnem razmiku in ki jih ne gre enačiti z migreno, saj so še veliko hujši od nje. Po poročanju nekaterih raziskovalcev naj bi nekatere ljudi pripeljali celo do samomora.